Памятник археологии, объект культурного наследия федерального значения. Одна из крупнейших многоэтажных карстовых пещер Урала. Карстовая полость образовалась в скальном массиве благодаря речке Подземный Шульган. Протяженность ходов — более 3,3 км. Пещера состоит из трёх высотных уровней. Имеет натечные образования, подземные озёра, сухопутные и подводные ходы (сифоны). Из голубого озера, расположенного у входа, вытекает река Шульган. Пещера оборудована трапами, ограждениями, лестницами, обзорными площадками. 
Первый этаж полностью затоплен водами реки Шульган. Второй этаж — открыт для посещения туристов. Третий этаж — закрыт для массового посещения. Здесь проводятся научные исследования. Там учёные обнаружили около 204 рисунков и их реликтов (красочных пятен) — это наскальная живопись эпохи палеолита (XV — XII тысячелетия до н.э.). Рисунки выполнены в основном охрой, изображены мамонты, лошади и другие животные, сложные знаки, антропоморфные фигуры. Экскурсоводы показывают гостям копии наскальных изображений, специально нанесённые художниками-реставраторами Эрмитажа на своды пещеры в Главной галерее в 2003 г. 
Четвертый этаж ученые открыли недавно. В нём было обнаружено множество сталактитов, возраст которых составляет более 100 000 лет.
Шульган-Таш — зона постоянного микроклимата. Вне зависимости от времени года тут всегда + 7 °C.